冷库风冷和水冷那个好并没有明确的区分，大型冷库建议用水冷，中小型冷库建议用风冷；
水冷优点：冷却效果好，环境因素影响小。缺点：前期投资成本高，难以迁移。而且水冷冷水机组是通过冷却塔对水进行冷却，以冷却水为冷源，以水为供冷介质进行制冷的一种空调设备。水冷冷水机组具有*、低噪音、结构合理、操作简洁、安装维护方便等优点，水冷冷水机组广泛应用于宾馆、商场、办公楼、展览馆、机场、体育馆等公共设施空调系统中。
风冷优点：投入少，可以迁移；缺点：冷却效果随环境温度变化而变化。冬天效果好，夏天比较差。就像家里的空调，夏天室外温度较高，制冷效果就会比较差。
从系统结构上看：风冷式机组采用空气冷却方式（风扇降温）；水冷机组采用冷却水冷却方式，水泵安装冷却塔及循环管路对机组循环降温。因此风冷机组只需风冷冷凝器及风扇即可。而水冷冷水机组需配冷却塔，水泵、循环管路。从结构上水冷要复杂于风冷。
从冷量上：例如20HP比泽尔中高温压缩机4NCS20.2 在蒸发温度0度冷凝温度50度时为38.6KW冷量，功率13.65KW，而水冷在相同工况时冷量为44.5KW，功率为12.1KW。从冷量和用电量来说略优于风冷机组。但水冷水泵功率冷却塔风扇功率还未加入计算。
从适用范围：风冷制冷机组适用于所处地域水源紧张的地区；对年运行时数越长的制冷系统采用风冷制冷机组越有利；风冷制冷机组的年度综合费用低于水冷系统，但水冷系统若管理得法，补水量控制在3％以下，则水冷机组的年度费用要低于风冷系统。风冷冷水机组采用空气冷却方式，省去了冷却水系统所必不可少的冷却塔、冷却水泵和管道系统，避免水质过差地区造成冷凝器结垢、水管堵塞，还节约了水资源，是目前制冷设备产品中，保养维修较经济、简单的机种.
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